La ONIC, como organización indígena de Colombia tiene como misión la reivindicación de los derechos de los pueblos indígenas. Desde su creación, la ONIC ha abanderado diversos procesos de lucha de los territorios indígenas de Colombia. La imposición de políticas estatales en detrimento de los valores culturales, el desconocimiento de los derechos territoriales y culturales integrales, la violencia y genocidio sistemático institucional y de los actores armados contra las etnias, entre otras, han sido algunas de las motivaciones fundamentales de los Pueblos Indígenas para mantenerse unidos bajo el techo de la Organización, y pelear, a las puertas de nuevos retos y desafíos, una plataforma de lucha sustentada en los siguientes principios culturales:

UNIDAD: Como mecanismo de fortalecimiento organizativo para la defensa de las comunidades indígenas.

TERRITORIO: Como elemento esencial para la vida y desarrollo de los pueblos indígenas.

CULTURA: Para el fortalecimiento, rescate y persistencia de la identidad como pueblos indígenas.

AUTONOMÍA: Para la aplicabilidad de los principios anteriores y como ejercicio de autoridad y poder.

En desarrollo de esos principios, los Pueblos Indígenas han defendido una plataforma de lucha sustentada en los principios filosóficos que rigen la organización: Defensa de la Autonomía Indígena; Defensa de los territorios indígenas y recuperación de las tierras usurpadas, propiedad colectiva de los Resguardos; Control de los recursos naturales situados en territorios indígenas; Impulso a organizaciones económicas comunitarias; Defensa de la historia, cultura y tradiciones indígenas; Educación propia bajo el control de las autoridades indígenas; Recuperación e impulso de la medicina tradicional y exigencia de programas de salud acordes con las características sociales y culturales de las comunidades; Exigencia de la aplicación de la Ley 89 de 1890 y demás disposiciones favorables a los indígenas; Solidaridad con las luchas de otros sectores sociales.